IncRNA requirements for mouse acute myeloid leukemia and normal differentiation

Abstract

Una fracción sustancial del genoma se transcribe de manera específica según el tipo celular, produciendo ARN largos no codificantes (IncRNAs), en lugar de transcritos codificantes de proteínas. Aquí, caracterizamos sistemáticamente la dinámica transcripcional durante la hematopoyesis y en las malignidades hematológicas. Nuestro análisis de IncRNAs anotados y ensamblados de novo mostró que muchos están regulados durante la diferenciación y desregulados en la enfermedad. Evaluamos la función de los IncRNAs mediante una pantalla de ARN interferente (RNAi) in vivo en un modelo de leucemia mieloide aguda. Esto identificó varios IncRNAs esenciales para el mantenimiento de la leucemia, y encontramos que varios actúan promoviendo las firmas de células madre de leucemia. Los blastos leucémicos muestran un fenotipo de diferenciación mieloide cuando estos IncRNAs fueron eliminados, y nuestros datos indican que este efecto se media a través de efectos sobre el oncogen MYC. Las reconstrucciones de médula ósea mostraron que un IncRNA expresado en todos los progenitores era necesario para la línea mieloide, mientras que los otros IncRNAs inducidos por la leucemia eran prescindibles en el contexto normal.